وبحكم ما كان يتمتّع به من ذكاء حاد وذهن وقّاد وحافظة قوية،فقد استطاع شيخنا الفاضل أن ينهي دراسته للمقدّمات والسطوح في ستّ سنوات، حضر بعدها البحوث العالية، التي يصطلح عليها في الحوزة بالخارج، وكان له من العمر آنذاك تسع عشرة سنة. فحضر الأبحاث الفقهية والاُصولية لسماحة آية الله العظمى السيد البروجردي وسماحة آية الله العظمى السيد الإمام الخميني(رحمهما الله)لمدّة إحدى عشرة سنة متواصلة، وكان يحضر وسنين طويلة دروس المرحوم العلاّمة الطباطبائي(قدس سره)في التفسير والفلسفة. وفي أثناء هذه المدة منحه العلاّمة الشيخ آقا بزرك الطهراني رحمه الله تعالى إجازة روائية.

في الوقت الذي كان سماحته مشغولاً بدراسة العلوم الحوزوية كان مشغولاً أيضاً بتدريسها، وهو في عمر خمس عشرة سنة، وقد عرف بكونه استاذاً بارزاً لها، وهذا أمر لم يقع إلاّ لعدّة قليلة من العلماء والفضلاء، وقد نال سماحته ذلك بفضل الله تعالى حيث منَّ عليه بكفاءة عالية وصبر ومواظبة وعمل علميّ دؤوب. إذ كان لا يترك فراغاً إلاّ وملأه بالدراسة والبحث. ممّا جعله يحظى بدرجة الاجتهاد، وهو في الخامسة والعشرين من عمره المبارك، باعتراف من استاذه السيد البروجرديّ(قدس سره).

راح سماحته يدرِّس كفاية الاُصول للمحقّق الخراساني في ستّ دورات كاملة، كما درّس المكاسب للمحقّق الأنصاري في خمس دورات كاملة.

يتربّع الشيخ الفاضل منذ سنين كثيرة على منبر تدريس البحث الخارج فقهاً واُصولاً ولجمع كبير غفير من الأفاضل والأعلام، كما راحت إذاعة الجمهورية الإسلامية تبثّ دروسه; ليستفيد منها من لم تسنح له الفرصة لحضور دروسه دام ظلّه.

وبعد رحيل الإمام الخميني(قدس سره) ـ الذي كان يؤكّد دائماً على أهمية وجود سماحة الشيخ محمد الفاضل في الحوزة العلمية، وضرورة الاستفادة من وجوده المبارك ـ رجع كثير من المؤمنين إليه في التقليد، وبعد رحيل آية الله العظمى الشيخ الأراكي عرّف ورشّح رسمياً من قبل جامعة المدرسين للحوزة العلمية بأنه الشخص الأول من بين أكابر الأعلام للزعامة الدينية والمرجعية في التقليد.

وكانت مدّة زعامته قريبة إلى خمس عشرة سنة، وله من المقلّدين في داخل إيران وفي خارجها من أورپا والبلدان الشرقيّة كآذربايجان وروسيا وأفغانستان وباكستان، كما أنّ له الكثير من المقلِّدين في البلدان العربيّة، والحقّ أن يُقال أنّه بحسب الكمّية كان في الصدر الأوّل بين المراجع الموجودين في زمانه.

مؤلّفاته

1ـ تفصيل الشريعة، شرح استدلاليّ لكتاب تحرير الوسيلة للإمام الخميني(قدس سره); وهو شرح مفصّل خرجت منه أجزاء كثيرة ستبلغ إن شاء الله إلى سبعة وعشرين جزءاً.

* الاجتهاد والتقليد.

* الطهارة (أربعة أجزاء).

* الصلاة، كانت مجلّداً واحداً، وقد طبعت مرّة ثانية محقّقه في مجلّدين.

* الزكاة، وهو قيد التحقيق.

* كتاب الخمس والأنفال.

* الحجّ (خمسة أجزاء).

* الأمر بالمعروف والنهي عن المنكر، والشفعه، والصلح، وهو قيد التحقيق.

* المكاسب المحرّمة.

* الإجارة.

* المضاربة، الشركة، المزارعة، المساقاة، الدين، الرهن، الحجر، الضمان،
الحوالة، الكفالة، الوكالة، الإقرار، الهبة.

* الوقف، الصدقة، الوصيّة، الأيمان والنذور والعهد، الكفّارات،
الصيد والذباحة.

* الغصب، إحياء الموات والمشتركات، واللقطة.

* النكاح.

* الطلاق والمواريث.

* القضاء والشهادات.

* الحدود.

* القصاص

* الديات.

2ـ تعليقة أنيقة على العروة الوثقى.

3ـ نهاية التقرير، الذي بين يدي القارئ العزيز.

4ـ شرح كتاب الاجتهاد والتقليد من العروة الوثقى.

5ـ كتاب القضاء، تقرير أبحاث السيد البروجردي(قدس سره).

6ـ المسائل المستحدثة، تقرير بحث الإمام الخميني(قدس سره).

7ـ رسالة في حكم الصلاة في اللباس المشكوك.

8ـ توضيح المسائل، رسالة عمليّة تتضمّن فتاواه في الأحكام الشرعيّة⁽¹⁾.

9ـ مناسك الحجّ، كتاب يتضمّن فتاواه في أحكام الحجّ والعمرة (بالفارسيّة والعربيّة).

10ـ استفتاءات حول الحجّ والعمرة «بالعربيّة والفارسيّة».

11ـ أحكام الحجّ من تحرير الوسيلة، مع تعليقات المرجع الديني آية الله العظمى الحاج الشيخ محمد الفاضل اللنكراني تتضمّن موارد الخلاف في النظر والفتوى.

12ـ رسالة في الخلل الواقع في الحجّ والعمرة.

13ـ القواعد الفقهيّة، وفيه عشرون قاعدة فقهية.

14ـ مدخل التفسير، يتضمّن مجموعة من مقدّمات مباحث التفسير; نظير إعجاز القرآن وصيانته من التحريف، وحول القراءات المتعدِّدة للقرآن الكريم.

15ـ آية التطهير رؤية مبتكرة (اهل بيت يا چهره هاى درخشان در آيه تطهير) بالعربيّة والفارسيّة.

16ـ الدولة الإسلاميّة (آئين كشوردارى)شرح لعهد الإمام علي(عليه السلام)إلى مالك الأشتر طبعت باللّغة العربيّة والفارسيّة.

17ـ حماة الوحي (پاسداران وحى) بالعربيّة والفارسيّة.

18ـ معتمد الاُصول، تقرير أبحاث الإمام الخميني(قدس سره) في مجلّدين.

19ـ مجمع الفهارس «مجموعة من فهارس بحار الأنوار والغدير والميزان».

20ـ جامع المسائل «استفتاءات باللغة الفارسية» في جزءين، وطبع مجلّد

واحد منها بالعربيّة والاُردو.

21ـ رسالة في قاعدة الفراغ.

22ـ اُصول فقه الشيعة في ستّ مجلّدات من تقريرات دروسه، كتبها بعض أفاضل شركاء بحثه.

23ـ دراسات الاُصول، في ثلاث مجلّدات أيضاً، كتبها بعض أفاضل شركاء بحثه.

24ـ تبيان الاُصول، في مجلّد واحد أيضاً، كتبها بعض أفاضل شركاء بحثه.

25ـ اُصول فقه شيعه، في عشر مجلّدات، كتبها بعض أفاضل شركاء بحثه، طبعت باللّغة الفارسيّة.

26ـ سيرى كامل در اُصول فقه شيعه، في ستّ عشر مجلّداً، مجموعة مخرّجة من إرشيف درسه، طبعت باللغة الفارسيّة.

27ـ سيرى كامل در خارج فقه معاصر، في خمسة أجزاء، مجموعة مخرّجة من إرشيف درسه، من مباحث الخمس والقضاء والشهادات. بالفارسيّة.

28ـ آئين كيفرى اسلام، في ثلاثة أجزاء، من تقريرات دروسه، كتبها بعض الأفاضل من شركاء بحثه. بالفارسيّة.

29ـ إيضاح الكفاية، في ستّة أجزاء، من تقريرات دروسه، كتبها بعض الأفاضل من شركاء بحثه. بالفارسيّة.

30ـ الأحكام الواضحة، رسالة عمليّة باللغة العربيّة.

31ـ ثلاث رسائل، يشتمل على قاعدة لا حرج والبحث عن كيفيّة إثبات الطلوع في الليالي المقمرة، وكذا البحث الفقهي عن عدّة من لا رحم لها من النساء.